一、文獻概況
伏尼契手稿（Beinecke MS 408）是現存最著名的未解讀手稿。它是一部羊皮紙抄本，約 240 頁（原約 272 頁，部分已佚），尺寸約 23.5×16.2 公分，以一種至今無法對應任何已知語言的文字（研究者稱為 Voynichese）寫成，字母約 20–25 個，由左向右書寫。按插圖主題，學界將其分為草藥、天文、生物、宇宙、藥物與食譜等部分：滿頁是無人能指認的植物、星象輪盤、浸泡在水中的人物、藥罐——沒有一株植物能被確證為地球上的已知物種。
從物質形態看，它是一部典型的中世紀抄本：約 23.5×16.2 公分，羊皮紙，18 個書帖（原 20 帖，部分佚失），部分書頁是可折疊的大幅插圖。墨水分析顯示文字與圖廓使用鐵膽墨水，顏料為當時常見的礦物與有機顏料，並無與 15 世紀矛盾的成分。紙頁邊緣的蟲蛀與翻閱痕跡顯示它曾被頻繁使用——中世紀學者 Lisa Fagin Davis 據此推測，它可能是一部實用的工作手冊（如醫書或星曆），而非儀式性聖物。
2009 年，亞利桑那大學對羊皮紙做了放射性碳定年，結果為 1404–1438 年（95% 信心水準）；墨水與顏料的分析也與 15 世紀初期相容。這一結果排除了幾種流行說法：它不可能是羅傑·培根（卒於 1292 年）的作品，也不可能是伏尼契本人在 20 世紀初的偽造。需要注意的是，碳定年測的是羊皮的年代，而非書寫的年代——理論上仍存在「舊皮新寫」的可能，但墨水分析並未發現與 15 世紀矛盾的成分。
手稿的近代流轉史是清楚的：1912 年，波蘭裔古書商 Wilfrid Voynich 在義大利羅馬附近弗拉斯卡蒂的蒙德拉貢別墅（耶穌會產業）購得此卷；此前它曾出現在布拉格魯道夫二世的宮廷（17 世紀初），並有 1665／1666 年 Marci 致 Kircher 的信件為旁證；1969 年，古書商 Hans P. Kraus 將其捐贈給耶魯大學貝內克珍本圖書館，編號 MS 408，現已全本數位化公開。
二、可以核實的部分
雙層結構是理解此條目的關鍵。第一層——物理實體——高度可核實：實物存在、尺寸材質可測量、碳定年有實驗室報告、收藏流轉有檔案可查。這些是 N1 級別的硬事實。
收藏史的鏈條大致可考：17 世紀布拉格煉金術士 Georg Baresch 是首位可確認的持有者，經 Jan Marek Marci 轉交耶穌會學者 Athanasius Kircher，後入羅馬耶穌會學院（Collegio Romano）圖書館沉寂近 250 年，1912 年由 Voynich 在整理耶穌會藏書時購得。鏈條中 1600 年之前的部分（包括「魯道夫二世以 600 金杜卡特購得」的說法）僅見於二手轉述，未完全證實，本檔案將其標為傳聞。
第二層——文本內容——完全未解：沒有任何一種譯解得到獨立驗證。一個世紀以來，職業與業餘密碼學家（包括一戰、二戰英美密碼破譯員）都未能讀出一個被公認的詞。2013 年，Montemurro 與 Zanette 在《PLOS ONE》發表資訊理論分析，發現文本的詞彙分佈、關鍵詞聚類與自然語言高度相容，符合齊夫定律，複雜度遠超簡單的亂碼或 DNA 序列，結論是「文本很可能載有真實訊息，而非騙局」。這是目前最有份量的科學發現，但它證明的是「有訊息」，不是「訊息是什麼」。
按插圖劃分的六個部分各有特徵：草藥部分篇幅最長，植物圖多配有分段文字；天文部分含黃道輪盤與星圖；生物部分多為管線相連的沐浴人物；宇宙部分有圓形圖解；藥物部分繪有藥罐；末尾是密集的文字段落（或為食譜）。各部分的用詞分佈存在顯著差異——這正是 PLOS ONE 研究用來提取「關鍵詞」的主題依據，也是「文本有內在結構」的重要證據。
三、學界的主要觀點與未解之謎
關於手稿的性質，學界並存數種假說：某種已知自然語言的加密文本、某種已失傳的自然語言、人造語言、精緻騙局（如 Rugg 提出的「格柵模板」機械生成說）、甚至宗教狂喜下的胡言記錄（glossolalia）。每一種假說都能解釋部分事實，沒有一種能同時解釋全部：例如騙局說難以解釋文本中超越 16 世紀數學水平的統計結構，而自然語言說又無法指認任何一種語言。
需要特別指出的是「已破解」宣稱的生態：幾乎每隔幾年就有新的「成功譯解」見報（如 2019 年的羅曼語族說），但無一通過學界獨立驗證。本檔案將所有「已譯解」宣稱一律視為未證實，不採信、不傳播。
2016 年，耶魯大學出版社出版了由 Raymond Clemens 主編的高清影印版，2020 年耶魯將全本數位影像公開上線。開放取用反而讓「破解宣稱」的檢驗變得更容易：任何宣稱都必須經得起公開文本的檢驗，而迄今沒有一種通過。這也是本檔案對此類宣稱採取「一律不採信」立場的底氣所在。
四、本檔案的立場
本檔案將伏尼契手稿定級為 N1（可核實史料）：實物的存在、年代的測定、收藏史，均有堅實證據。但 N1 定級的是「手稿」，不是「手稿的內容」——內容至今未解，任何關於其含義的主張（藥典、煉金術手冊、外星訊息等）都屬推測，本檔案不予認定。
本檔案的寫法是「高可信史實＋未解主張」雙層：讀者可以確信這是一件 15 世紀初的真實文物，也可以確信它的文字至今無人能讀。這種「確定的未知」，正是它成為密碼學史上著名案例的原因。
順帶一提，貝內克圖書館曾公開表示，不時收到希望「取用手稿碎片以治病」的請求——這是圍繞神秘文本的民間信仰的當代標本，本檔案僅作一筆記錄，不評價。